Устранить протечку, заменить гидроизоляцию. Необходимо загерметить стык трубы и гриба, ну и возможно прошурупить пару мест (надо по месту смотреть что там случилось).
Отремонтировать примыкания, устранить протечку. Демонтировать: рубероид. Положить: материал кровли по рекомендации специалиста. Что нужно ещё: помощь с покупкой и доставкой материалов.